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不同來(lái)源的蛋白，內(nèi)參的選擇
不同來(lái)源的蛋白，內(nèi)參的選擇
Commonly Used Organelle Markers
· Fractions · | Markers |
Cytosol （胞漿蛋白） | Actin(42 KD),GAPDH(37 KD), Tubulin(50 KD), HSP90(90 KD) |
Nuclear （胞核蛋白） | Lamin-B1(75 KD，Nuclear envelope) HDAC1(55 KD，Nucleolar) SC-35(35 KD，Nuclear speckle) NUP98(100 KD, Nuclear pore), Histones? P84(84KD，Nuclear Matrix) |
Plasma Membrane （細(xì)胞膜蛋白/器膜蛋白） | Na/K-ATPase(100KD) Pan-cadherin(135 KD, Tissue specific express.) |
Mitochondria （線粒體） | Cytochrome C Reductase Core protein (53 KD) ATP5A(55 KD，inner membrane) Tomm20(20 KD, outer membrane) VDAC(Mito outer membrane, and PM) |
Endoplasmic reticulum (ER)（內(nèi)質(zhì)網(wǎng)） | Calreticulin (55 KD，lumen) Calnexin (68 KD, ER membrane, PM) |
Golgi Complex （高爾基復(fù)合體） | GM130(130 KD,Cis golgi matrix) Syntaxin 6 or Lamb2 (29 KD, Golgi membrane) |
Lysosome （溶酶體） | LAMP2(100 KD, lysosome, PM, Endosome) M6PR 274,(lysosome membrane) LIMPIl/lpg85(54KD, Lysosome membrane) |
Proteasome （蛋白酶體） | PSMC1(49KD) |
Endosome （內(nèi)含體） | EEA1(170KD)
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Exosome （外泌體） | CD63(26KD)，Alix(96KD)，CD9(25KD)，CD81(26KD)
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Lipid Raft （脂筏） | Flotillin-1(47KD) |
內(nèi)參的選擇需要考慮實(shí)際的試驗(yàn)環(huán)境，比如某些細(xì)胞中，由于組織缺氧、糖尿病等因素會(huì)導(dǎo)致GAPDH的表達(dá)增高，不適合做內(nèi)參。比如在在凋亡實(shí)驗(yàn)時(shí)，Lamin等也不適合作為內(nèi)參。因此設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)方案的時(shí)候應(yīng)該考慮這些因素并查詢相應(yīng)文獻(xiàn)，在實(shí)驗(yàn)過(guò)程中也應(yīng)該注意如果內(nèi)參表達(dá)出現(xiàn)異常，應(yīng)考慮這方面因素。
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